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蛋白质模拟 原理、发展和应用 by 王存新等编 is a book available to read on EtoBox.
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3 (p1): 第一部分 分子动力学模拟方法3 (p1-1): 第1章 分子动力学模拟的原理、方法与进展3 (p1-1-1): 1.1 引言4 (p1-1-2): 1.2 生物大分子的经典力学模型与常见力场4 (p1-1-2-1): 1.2.1 经典力学模型5 (p1-1-2-2): 1.2.2 常见分子力场7 (p1-1-3): 1.3 积分算法7 (p1-1-3-1): 1.3.1 体系的动力学方程7 (p1-1-3-2): 1.3.2 动力学方程的数值解法9 (p1-1-4): 1.4 周期性边界条件10 (p1-1-5): 1.5 约束条件动力学模拟10 (p1-1-5-1): 1.5.1 SHAKE算法12 (p1-1-5-2): 1.5.2 LINCS算法12 (p1-1-6): 1.6 非键相互作用13 (p1-1-6-1): 1.6.1 短程相互作用13 (p1-1-6-2): 1.6.2 MD模拟中长程静电相互作用的常用算法17 (p1-1-7): 1.7 恒温恒压分子动力学模拟17 (p1-1-7-1): 1.7.1 温度控制方法21 (p1-1-7-2): 1.7.2 压力控制方法23 (p1-1-8): 1.8 溶剂模型23 (p1-1-8-1): 1.8.1 隐含溶剂模型24 (p1-1-8-2): 1.8.2 显含溶剂模型24 (p1-1-9): 1.9 分子动力学模拟的主要步骤31 (p1-1-10): 1.10 蛋白质分子动力学模拟的进展与前景32 (p1-1-11): 参考文献37 (p1-2): 第2章 拉伸分子动力学模拟37 (p1-2-1): 2.1 引言38 (p1-2-2): 2.2 拉伸分子动力学模拟方法39 (p1-2-3): 2.3 拉伸分子动力学模拟实例39 (p1-2-3-1): 2.3.1 周质结合蛋白与配体相互识别研究46 (p1-2-3-2): 2.3.2 抗癌多肽p28与肿瘤抑制蛋白p53的拉伸分子动力学研究52 (p1-2-4): 参考文献56 (p1-3): 第3章 膜蛋白体系的分子动力学模拟56 (p1-3-1): 3.1 引言57 (p1-3-2): 3.2 膜蛋白分子动力学模拟研究进展57 (p1-3-2-1): 3.2.1 膜的性质和脂质分子的类型57 (p1-3-2-2): 3.2.2 膜蛋白的性质和类型58 (p1-3-2-3): 3.2.3 分子动力学模拟在膜研究方面的应用59 (p1-3-2-4): 3.2.4 分子动力学模拟在膜蛋白体系的应用60 (p1-3-3): 3.3 膜蛋白体系分子动力学模拟的基本方法和步骤62 (p1-3-4): 3.4 BtuC-POPC膜蛋白体系的分子动力学模拟62 (p1-3-4-1): 3.4.1 研究背景62 (p1-3-4-2): 3.4
- Author
- 王存新等编
- Publisher
- 北京:科学出版社
- Published
- 2016
- Language
- ZH
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